Campus Científico-Tecnológico
Existen cuatro edificios vinculados a la Facultad de Ciencias todos ellos situados en el Campus Científico-Tecnológico.

- Edificio Ciencias - Biología: Sede de la Sección Biología, de sus estudios y varios departamentos. Se encuentra ubicado junto al apeadero de Renfe de Alcalá-Universidad.
- Aulario Ciencias - Biología: se encuentra cercano también al apeadero de RENFE junto al Edificio de Ciencias.

- Edificio Ciencias Ambientales: junto al Hospital Universitario Príncipe de Asturias, sede de la Sección de Ciencias Ambientales y Criminalística, de Ecocampus, de la Oficina Sócrates y del Gabinete Psicopedagógico.

- Edificio Polivalente - Química: junto a la Facultad de Farmacia, sede de la Sección de Química
Cómo llegar:
- Autobuses interurbanos desde Madrid: Línea 227. Salida desde el Intercambiador de Avda. América.
- Cercanías RENFE: Hay trenes de cercanías que llegan a la estación "Alcalá Universidad". El tiempo estimado desde la estación de Atocha, en Madrid, es de 39 minutos y desde la de Guadalajara de 15 minutos.
- En coche: Desde Madrid por la A-2 (Autovía Madrid-Barcelona), tomando el desvío de Meco, Alcalá de Henares (Hospital Universitario), situado en el kilómetro 31.7, se accede directamente al Campus científico-tecnológico, y desde Guadalajara tomando el desvío Meco, Alcalá de Henares (Hospital) en el kilómetro 32.2.